Η εφηβική αυτοκτονία δεν ήταν πρωτόγνωρη πριν από τη δεκαετία του 1990, αλλά οι αυξανόμενες περιπτώσεις κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου οδήγησαν τους ανθρώπους να αναγνωρίσουν το πρόβλημα. Τα σχολεία άρχισαν μάλιστα να δημοσιεύουν υλικό για να εκπαιδεύσουν μαθητές και γονείς σχετικά με τα φαινόμενα. Η Παναγία αυτοκτονεί αντιμετωπίζει αυτό το λεπτό θέμα ευθέως. Η Σοφία Κόπολα συνδυάζει στοιχεία του δικού της στυλ με εκείνα του κλασικού φιλμ νουάρ για να δείξει πώς αυτά τα νεαρά άτομα αποξενώνονται τόσο πολύ σε έναν κόσμο που μετά βίας γνωρίζουν ή καταλαβαίνουν. Μέσα από τα μάτια πέντε προστατευόμενων έφηβων κοριτσιών, η Κόπολα ανοίγει ένα σκοτεινό σύμπαν απομόνωσης.
Από την αρχή της ταινίας, αναγνωρίζεται ότι τα πέντε κορίτσια της Λισαβόνας πέθαναν όλα πριν φτάσουν στην ενηλικίωση. Μια μικρή ομάδα αγοριών, τώρα ανδρών, από τη γειτονιά της Λισαβόνας δεν ξέχασαν ποτέ τις μυστηριώδεις αδερφές τις οποίες δεν κατάφεραν ποτέ να καταλάβουν εντελώς. Ένας από τους άντρες αφηγείται την ταινία και ενημερώνει τον θεατή ότι αυτός και οι φίλοι του εξακολουθούν να συγκεντρώνονται σε κάθε συνένωση γυμνασίου και πάρτι γενεθλίων για να συζητήσουν την τύχη των κοριτσιών της Λισαβόνας.
Στη συνέχεια, η ταινία κάνει φλας πίσω στην παιδική τους ηλικία περίπου το 1975, και παρουσιάζει τα κορίτσια καθώς βγαίνουν από το στέισον της οικογένειάς τους. Η Σεσίλια είναι η νεότερη στα 13, ενώ προηγήθηκε η Λουξ, η Μπόνι, η Μαίρη και η Τερέζ που ήταν όλες ένα χρόνο μεγαλύτερες από τις άλλες. Όλα τα κορίτσια φαίνονται τόσο νέα, αθώα και όμορφα. Ωστόσο, σύντομα αποκαλύπτεται ότι η Σεσίλια μόλις βγήκε από το νοσοκομείο μετά από απόπειρα αυτοκτονίας.
Η Σεσίλια αρχίζει να βλέπει έναν θεραπευτή που συνιστά οι αυστηροί της Λισαβόνας να επιτρέπουν στις κόρες τους να κάνουν ένα πάρτι για να φτιάξουν τη διάθεση των κοριτσιών και να τους επιτρέψουν να αλληλεπιδράσουν με αγόρια και κορίτσια της ηλικίας τους. Η Σεσίλια αναστατώνεται από μια ομάδα συνομήλικών της που κοροϊδεύει ένα παιδί με σύνδρομο Down. Νιώθει ότι δεν θα ανήκει ποτέ πραγματικά στην κοινωνία και έτσι τρέχει πάνω και πηδά από το παράθυρό της. Η δεύτερη απόπειρά της να αυτοκτονήσει είναι επιτυχής αφού προσγειώνεται σε έναν μυτερό, σφυρήλατο φράχτη. Το υπόλοιπο της ταινίας πραγματεύεται τον αγώνα της Λισαβόνας να αντιμετωπίσει αυτή τη νέα πραγματικότητα. Στο τέλος, οι εναπομείνασες αδερφές αποφασίζουν ότι η Σεσίλια είχε δίκιο για το ότι ο κόσμος ήταν ένα ζοφερό και μοναχικό μέρος όπου η ίδια η ύπαρξη είναι μάταιη, και έτσι αποφασίζουν να ενωθούν μαζί της αφαιρώντας τη ζωή τους.
Αν και Η Παναγία αυτοκτονεί δεν είναι σε καμία περίπτωση ένα κλασικό φιλμ νουάρ, είναι αναμφισβήτητο ότι ο Κόπολα επηρεάστηκε από τις ιδέες που φέρνει στο μυαλό. Η διάθεση κάποιων σκηνών, για παράδειγμα, έχει παραλληλισμούς με αυτή του φιλμ νουάρ. Άλλωστε, η Coppola σκοπεύει να φέρει το κοινό στον παράξενο και βαρύ κόσμο στον οποίο ζουν αυτά τα καταδικασμένα κορίτσια. Τόσο οι σκηνές αυτοκτονίας όσο και η σκηνή όταν ο Τριπ αφήνει τη Λουξ στη μέση του γηπέδου ποδοσφαίρου αφού κάνει σεξ μαζί της προκαλούν μια αίσθηση ανησυχίας και ασύλληπτου που είναι σίγουρα χαρακτηριστικό του φιλμ νουάρ. Η Παναγία αυτοκτονεί επηρεάζεται επίσης από θέματα νουάρ και στυλ. Η ταινία είναι πρωτίστως για αυτά τα έφηβα κορίτσια που νιώθουν χωρισμένα από το πλήθος, κολλημένα στη μισή πραγματικότητα που ήταν το σπίτι τους. Τα πάντα σχετικά με το σπίτι της Λισαβόνας είναι μονότονα και γκρίζα. Δεν υπάρχει ποτέ άμεσο ηλιακό φως ή φωτισμός υψηλής έντασης μέσα στο σπίτι της Λισαβόνας. Λες και τα κορίτσια είναι καλυμμένα με ιστούς αράχνης σαν μικρές πορσελάνινες κούκλες που διατηρούνται σε ένα υπόγειο κάπου. Ο Κόπολα χρησιμοποιεί το φως σε όλη την ταινία για να συμβολίσει τη ζωή και την αλλαγή, όπως τα κοψίματα σε υπαίθριες λήψεις με time-lapsed με τον ήλιο να λάμπει στο βάθος. Αυτό δείχνει επίσης ότι τα πράγματα έξω αλλάζουν, αλλά τα κορίτσια της Λισαβόνας αναγκάζονται να παραμένουν στάσιμα στα δωμάτιά τους.
Η Παναγία αυτοκτονεί έχει επίσης ένα ιδιαίτερα νευρικό σκορ για τη χρονική περίοδο που προοριζόταν να εκπροσωπήσει. Οι τίτλοι κομματιών περιλαμβάνουν “Cemetery Party”, “Dirty Trip” και “Bathroom Girl”. Αυτά είναι τραγούδια που η κυρία Λισαβόνα σίγουρα δεν θα επέτρεπε στα παιδιά της να ακούσουν. Η Κόπολα το κάνει ακόμη και κάτι τέτοιο δείχνοντας τη Λουξ να καίει όλα τα ροκ CD της στα χέρια της μητέρας της. Αυτό αντιπροσωπεύει την εξουσία που εξακολουθούν να έχουν οι γονείς των κοριτσιών στη ζωή τους, αλλά η παρτιτούρα που εξακολουθεί να παίζει σε όλη την ταινία αντιπροσωπεύει τον αγώνα τους να φτιάξουν μια θέση για τον εαυτό τους. Ίσως τα κορίτσια να τα κατάφερναν και απλά να πνίγονταν. Πιο πιθανό, ωστόσο, είναι ότι τα κορίτσια δεν έβλεπαν καμία ελπίδα να ζήσουν για ένα μέλλον που έβλεπαν ως μοναχικό, δύστροπο και ανεκπλήρωτο.
Η Παναγία αυτοκτονεί ξεφεύγει επίσης από το νουάρ και παρατηρούνται πιο σύγχρονες συμβάσεις δημιουργίας ταινιών. Η Lux Lisbon δεν είναι η κλασική femme fatale του φιλμ νουάρ. Γνωρίζει το σεξ της και ότι μπορεί να το χρησιμοποιήσει προς όφελός της, ωστόσο δεν προσπαθεί να εξαπατήσει τους άντρες με τους οποίους κοιμάται. Ο Λουξ απλώς προσπαθεί να δικαιολογήσει αυτό που συνέβη με τον Τριπ. Έκανε σεξ μαζί του μετά τον χορό τους στο Homecoming επειδή νόμιζε ότι νοιαζόταν για εκείνη και μετά την άφησε να κοιμάται στο γήπεδο ποδοσφαίρου. Ο Λουξ, που ήταν μόλις δεκαπέντε ετών, επηρεάστηκε πραγματικά από αυτό. Τότε αντιδρά προσπαθώντας να αποδείξει στον εαυτό της ότι το σεξ δεν σημαίνει τίποτα. Τότε θα ήταν εντάξει αν έχανε την παρθενιά της από τον Τριπ χωρίς καλό λόγο.
Η ιστορία των δύσμοιρων αδελφών της Λισαβόνας έπρεπε να ειπωθεί σε ένα σύγχρονο πλαίσιο, ενώ ο κόσμος στον οποίο ζουν και οι εμπειρίες που έχουν μερικές φορές είναι νουάρ. Ως εκ τούτου, απαιτούνταν μια πραγματική έγχυση μερικών διαφορετικών στυλ και ειδών. Η Sofia Coppola κάνει θαυμάσια δουλειά αναμειγνύοντας τις συμβάσεις του φιλμ νουάρ με το δικό της θεματικό ύφος προς την κατεύθυνση του Η Παναγία αυτοκτονεί. Η μουσική και ο φωτισμός της ταινίας είναι παρόμοια με το νουάρ, όπως είναι το γενικό θέμα της ταινίας και το σκηνικό όπου οι μέρες συνδυάζονται και ακόμη και το σεξ δεν έχει νόημα. Ωστόσο, καμία από τις αδερφές δεν θυμίζει αρκετά μια κλασική femme fatale. Επίσης, τα αγόρια μπορεί να είναι σαν κατώτεροι ντετέκτιβ, αλλά δεν έχουν απώτερα ή κρυφά κίνητρα. Ο σεβασμός και η απορία τους για τις αδερφές της Λισαβόνας είναι ειλικρινής, και αυτό είναι κάτι που δεν μπορεί να υπάρξει σε ένα φιλμ νουάρ.